在民事诉讼中，有营业执照字号的个体工商户主体资格涉及两类案件，一类是普通民事案件，一类是劳动争议案件，两类案件适用不同的法律。在诉讼中的主体资格也有区别，人民法院对此应严格的区分，并分别不同情况依法予以裁决。　　

一、在普通民事案件的适用上。主要是指普通民事案件（除劳动纠纷以外的案件），《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉若干问题的意见》第46条规定，在诉讼中，个体工商户以营业执照上登记的业主为当事人。有字号的，应在法律文书中注明登记的字号。营业执照上登记的业主与实际经营者不一致的，以业主和实际经营者为共同诉讼人。因此在普通民事案件中，应以营业执照上登记的业主为当事人（原、被告（被申请人）），有字号的，应在法律文书中注明登记的字号。　　

二、在劳动争议案件的适用上（包括劳动仲裁、劳动调解）。《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释（二）》第9条规定：劳动者与取有字号的个体工商户产生的劳动争议诉讼，人民法院应当以营业执照上登记的字号为当事人，但应同时注明该字号业主的自然情况。有营业执照字号的个体工商户作为原告（申请人）起诉时，原告（申请人）名称为营业执照上登记的字号，但应同时注明该字号业主的自然情况。若以业主为原告（申请人），经法庭（仲裁庭）释明后，当事人仍坚持不变更，则裁定驳回起诉；有营业执照字号的个体工商户作为被告（被申请人）被起诉时，被告（被申请人）名称仍然应为营业执照上登记的字号，但应同时注明该字号业主的自然情况，若原告（申请人）列错被告（被申请人），一般有两种方式处理：一是撤诉，并在仲裁15日期限内另行起诉；二是经法庭释明后，当事人仍坚持不变更，以被告（被申请人）主体不适格裁定驳回起诉。